Gli scienziati hanno appena annunciato la scoperta di un nuovo, incredibile un virus comune che vive all’interno dell’essere umano batteri intestinali. Ha ottenuto il nome “crAssphage” e quasi alle sei volte più comune di tutti gli altri virus batterici mettere insieme. Ma come siamo riusciti a non notarlo così tanto tempo?
foto da fonti aperte
Il motivo per cui non abbiamo mai trovato crAssphage prima è perché che non sapevamo che dovevamo cercarlo. Questo è quello che è mezzi.
Mentre le nuove tecnologie di sequenziamento stanno diventando sempre di più veloci ed economici, hanno ancora un punto debole: loro buono per scoprire cose che già sappiamo esistono ma sono scarsamente adatti alla ricerca di nuovi organismi. quando i ricercatori studiano un campione organico da cui ottengono la zuppa Frammenti di DNA di tutti gli esseri viventi legati a questo campione – batteri, virus e la persona stessa. Quindi questi frammenti dobbiamo essere assemblati nella sequenza che possiamo identificare. Se troviamo una catena specifica del genoma alcuni batteri – ciò significa che abbiamo trovato questo batterio nel campione.
Il problema è che se non lo sappiamo ancora sequenze di un virus a noi sconosciute – non possiamo rilevare utilizzando questa tecnica. Ma in effetti, l’autore del nuovo La ricerca di crAssphage Bas Datil riporta che sono quasi sconosciuti 75 percento delle sequenze di DNA nei campioni che hanno studiato.
Il team di Datila è stato in grado di trovare un nuovo virus utilizzando uno completamente diverso approccio basato su un’idea semplice: frammenti di volta in volta si trovano nello stesso campione, con un alto grado di probabilit� fanno parte di un singolo genoma. Hanno usato la tecnica così chiamato cross-assembly per identificare uno di questi gruppi ripetendo sequenze in campioni prelevati da 12 persone. Quindi hanno assemblato queste sequenze in un singolo genoma.
E hanno ottenuto esattamente questo: virus crAssphage, che prende il nome da esso tecnica di assemblaggio incrociato, che ha portato alla sua scoperta. Hanno scoperto che crAssphage vive all’interno di Bacteroides – un gruppo comune di batteri che vivono nel nostro intestino.
Come risultato della ricerca, il team ha riscontrato crAssphage nel 75% sequenze intestinali di persone negli Stati Uniti, in Europa e in Corea del Sud. Lo siamo finché non sappiamo cosa fanno esattamente questi fagi nell’intestino, ma loro sicuramente gioca un ruolo nel nostro microbico intestinale ecosistema.
E infine, un fatto interessante: gli scienziati lo hanno calcolato nel nostro il corpo è circa 100 volte più particelle virali che effettivamente cellule umane. Quindi abbiamo ancora molto lavoro da fare. scopri cosa siamo veramente.
Virus del DNA
